製 品 案 内 株式会社ＲＮＡｉ 〒 東京都文京区本郷4-1-4コスモス本郷ビル10F

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1 製 品 案 内 株式会社ＲＮＡｉ 〒113-0033 東京都文京区本郷4-1-4コスモス本郷ビル10F
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2 課題が山積しており、RNAi研究はこれからがチャンスです！
基礎研究から創薬・診断マーカー探索研究において多くの研究者を悩ませてきた課題に対して 解決策を提供いたします。 ∞　細胞実験に10nM 以上の高濃度siRNA を用いていたが、低濃度でも使いたい ∞　非標的遺伝子へのオフターゲット効果、副作用が気になる ∞　適切なネガティブコントロール配列を選択したい ∞　バリデーション済みでも、siRNAのオフターゲット効果、副作用を調査していない ∞　non-cording RNA への影響も考慮したい ∞　siRNA のmiRNA 様挙動を検討できていない ∞　アレル遺伝子、疾患関連遺伝子と正常遺伝子の配列が類似していて配列設計できない ∞　siRNA では、動物実験・創薬に不十分に思う ∞　網羅的研究にsiRNA は高価すぎる ∞　BLAST では短鎖配列の高精度な調査ができないと聞いた ∞　RNAi 実験の方法が分からない 課題が山積しており、RNAi研究はこれからがチャンスです！

3 ＲＮＡｉ社では、高品質な任意のＲＮＡ合成を『siPerfect®オーダーメード』として承ります。
　　高機能配列選択アルゴリズムによる高活性かつオフターゲット防止を考慮したsiRNA設計 商用版siDirect®は、東京大学西郷薫教授・程久美子助教授・森下真一教授等のウェット・ドライ研究成果１,2,3を基盤として、創薬研究に必須の機能を強化したsiRNA配列設計システムです。 効果的なsiRNAを選び出す配列選択ルールと、高速な配列処理を可能にするアルゴリズムを組み合わせることによって、オフターゲット作用を最小限に抑えつつ、効果的なsiRNAを設計できま す。 類似の配列を持つような、複数転写産物（トランスクリプトバリアント、アイソフォーム、種間等）から配列の異なる部分を見つけ出すことによって、目的の配列だけを標的にする、つぶし分けを可能にする配列設計や、標的遺伝子の二次構造、non-coding RNAに対するオフターゲット作用等を システム上で確認することが可能です。 弊社のsiRNA配列設計法は、国内特許第 号で権利化されています。最大の特徴は、siDirect®を用いて網羅的にオフターゲット効果を検証してリスクの最小化を計ることができる点です。弊社のsiDirect®アルゴリズムは、速度、精度、拡張性に優れています。また、遺伝子データベースには、日々新しい情報が追加されており随時配列情報を変更して調査する必要があります。弊社のオフターゲット検索データベースは、最新のリリースに対応することによって、常に最新の情報に基づいた配列設計が可能です。最新の情報に基づいた配列設計をすることによって、プレデザインのsiRNAに比べて、オフターゲット作用や遺伝子配列修正に対応することが可能 です。 1. Naito Y, Yamada T, Ui-Tei K, Morishita S, Saigo K. (2004) siDirect: highly effective, target-specific siRNA design software for mammalian RNA interference. Nucleic Acids Res. 32, W124-W129. 2. Yamada T and Morishita S. (2005) Accelerated off-target search algorithm for siRNA, Bioinformatics, 21(8): 3. Ui-Tei K, Naito Y, Saigo K. (2006) Guidelines for the selection of effective short-interfering RNA sequences for functional genomics. Methods Mol. Biol. 361, 精製グレード 容量 価格(税抜) 価格(税込) ご注文単位 RPCグレード 10nmol ￥ 15,000 ￥ 15,750 4種以上 20nmol ￥ 22,500 ￥ 23,625 250nmol ￥ 83,000 ￥ 87,150 1種より 400nmol ￥160,000 ￥168,000 HPLCグレード ￥ 26,750 ￥ 28,088 ご相談下さい ￥ 36,500 ￥ 38,325 80nmol ￥ 64,500 ￥ 67,725 in vivoグレード ￥ 65,000 ￥ 68,250 ￥ 87,750 ￥ 92,137 ￥143,000 ￥150,150 注：価格は変更になる可能性があります

4 安定性が高く、免疫誘導性の低いキメラ型RNAiを利用可能です
東京大学理学系研究科西郷薫教授らの研究成果4であるキメラ型RNAiは、安定性が高く免疫誘導性の低いことが確認されており、siRNAに比べて動物実験での利用に適しています。 キメラ型RNAiはsiRNAの一部を下図のようにDNAに変えたものです。 配列設計方法は、siRNAの場合もキメラ型RNAiの場合も弊社の配列設計法を変わらず適用することができます。siRNAに比べてキメラ型RNAiには以下の利点があります。 （１）高い安定性 Rnaseに対する耐性が高いため、siRNAが血清中では数時間で完全に分解されてしまうのに対して、保護剤がない場合でも血清中で約24時間検出可能であることが確認されています。このため動物実験において、siRNAよりも有利であると考えられます。 （２）免疫応答誘導性が低い dsRNAではないため、細胞に対する免疫応答の誘導性が低く、物質としての細胞毒性が低くなると考えられています。また、特殊な修飾を施していないため代謝産物が生体由来のものになります。 （３）製造コストの低減が可能 RNA合成単価に比べてDNA合成単価は安価であるため、大量合成をする段階において合成コストを大きく低減できる可能性があり、現在研究が進んでいます。 （４）複雑な特許問題をクリア キメラ型RNAiの技術は、平成18年5月に特許成立（特許 号）した東京大学理学系研究科西郷教授等の研究成果であり、近々欧米、中国、インド等で成立する見込みです。 キメラ型RNAiはsiRNAの弱点を克服したものであり、動物実験と共に実験結果が安定しない感受性の高い細胞実験で威力を発揮しています。弊社ではin vitroの実験は従来どおりのsiRNAをin vivoやスケールアップの実験にキメラ型RNAiをお勧めしています。キメラ型RNAiはin vivo以降にその強みを発揮する新しいRNAiツールであるといえます。もちろんオフターゲット検索等、こ れまでの弊社の全技術がキメラ型RNAiの設計にも生かされています。 4. Ui-Tei K, Naito Y, Zenno S, Nishi K, Yamato K, Takahashi F, Juni A, Saigo K. (2008) Functional dissection of siRNA sequence by systematic DNA substitution: modified siRNA with a DNA seed arm is a powerful tool for mammalian gene silencing with significantly reduced off-target effect. Nucleic Acids Res., in press. DNA

5 ヒトバリアントを最大限共通に抑制するsiRNAの中で、マウスホモログバリアントを最大限共通に抑制するsiRNAを選んでいます。
RNAi社のsiRNAライブラリ『siPerfect®ライブラリ』は、約9000種類の遺伝子に対して弊社にて検討を重ねて設計したsiRNAのセットです。 １プレートに80種類のsiRNAが入っており、1プレート単位で販売しています。各プレートに収録されているsiRNAの対象遺伝子等の情報は、弊社のsiPerfect®ライブラリオンラインカタログより検索することができます。現在以下の製品ラインナップがあります。 (1)　バリアント共通に抑制 ターゲット遺伝子はシンボル名ベースで取得しています。そのため、ターゲット遺伝子座に複数の転写産物が含まれる場合は、転写産物間の配列共通部分からsiRNAを設計し、全ての転写産物を同時に抑制できるように設計されています。 (2)　ヒト・マウス最大限共通である ヒトバリアントを最大限共通に抑制するsiRNAの中で、マウスホモログバリアントを最大限共通に抑制するsiRNAを選んでいます。 プレートごとに、最高80%、平均で約60%のsiRNAはヒト・マウス共通で利用できるようになっています。また、ヒト・マウスで保存されている部位を利用したため、結果的に、ラットでも共通となっている配列も多く含まれています。このため、ヒトだけでなくマウスでも利用することができます。 (3)　オフターゲット作用の最小化が図られている オーダーメード製品におけるsiRNA配列設計法と同等の設計法が適用されているため、オフターゲット作用は正確に最小化が図られています。ターゲット配列以外の既知の全ヒト遺伝子に対して、siRNA配列のオーバーハングを含まない中央の19merが、少なくとも３ミスマッチ以上離れて いることを保証しています。 『siPerfectScreen』はアライアンステクノロジー社と連携して開発した、細胞を播種するだけでsiRNAのトランスフェクション操作が完了するレディーメードsiRNAのプレコートプレート製品です。 ライセンシーには1プレート31,500円(税込)にて、非ライセンシーには2プレート102,900円 (税込) にて提供しています。トランスフェクションが困難な細胞にも高効率で導入可能です。 siPerfectライブラリラインナップ siPerfectライブラリ 注：デザインは変更になる可能性があります

6 siDirectシステムスナップショット
無償で開放しています。ライセンシーへ提供する機能に関しては下図をご参照ください。 siDirect フルライセンス 基礎研究 ライセンス 非ライセンシー 非営利目的の 学術・研究機関 ライセンシー価格でのsiRNA購入 ○ - ライセンシー価格でのキメラRNAiの購入 siRNAライブラリ(siPerfectライブラリ)購入 △ 基礎研究向けのsiRNA/キメラ配列の利用 創薬・診断向けのsiRNA/キメラ配列の利用 効果的なsiRNA配列設計 バリアントのつぶしわけ設計 遺伝子に対するオフターゲット探索 mRNA二次構造予測を考慮した siRNA設計 ゲノムに対するオフターゲット探索 miRNA様アライメント 年間ライセンス料 バイオ・医薬品の売り上げ に応じた価格設定です 無償 siDirectシステムスナップショット

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