杉山耕一朗（北大理） 2009/02/06 epnetfan PC クラスタの作り方(その２) 杉山耕一朗（北大理） 2009/02/06 epnetfan
PCクラスタとは 複数台の PC をネットワーク接続することによって構築されるメモリ分散型の並列計算機
国立天文台 CfCA 汎用 PC システム
なぜ, PCクラスタ? スパコンは性能当たりの価格が高い 特注品よりも汎用品で 「スーパーコンピューティングの将来」 （牧野淳一郎）より抜粋 http://jun.artcompsci.org/articles/future_sc/note006.html#rdocsect5
クラスタ構築プロジェクト(kodama) 最近立ち上げ 機材一式を購入 組み立て終了 でも卒論・修論のため，一時凍結 杉山が冬休みに遊んでみただけ
本日のお話 クラスタの構成のおさらい 実際にサーバの設定や計算ノードの追加方法を実演 kodama プロジェクトの主力である４年生たちに，簡単に作れそうだという実感を持ってもらう 教科書となる書籍は多分無い.
構成 ログインノード 計算ノード ユーザがログインして，ジョブを投入 台数は, １ないし少数 投入されたジョブを実際に計算する ディスクレス 台数はお好きなだけ(9 台)
起動の流れ（計算ノード） USB メモリから起動 USB メモり内に, カーネルが存在 ネットワークの設定 root システムは，ログインノードのディスクを NFSroot するよう設定
作業1: ログインノードの構築 Debian のインストール 設定 ネットワークの設定 (NIC 2 枚挿し) NFS の設定 計算ノードは private IP を利用するので. NFS の設定
作業2: 計算ノード用カーネルの作成 計算ノード用のカーネルを再構築 NFSroot IP: kernel level autoconfiguration NIC のドライバをカーネルに組み込む
作業 3: 計算ノードのシステムを用意 計算ノード用のルートシステムを用意 debootstrap --arch=amd64 lenny /home/kodama/001 計算ノード用のカーネルをインストール nfs-common, sudo, ssh 等をインストール /etc/hosts, /etc/fstab, /etc/hostname, /etc/network/interfaces を編集
作業 4: 起動用 USB ディスクを作成 FAT16 にフォーマットして, syslinux をインストール． fdisk 等でパーティション作成 FAT16 でフォーマット syslinux をインストール カーネルを USB ディスクにコピー syslinux 用の設定ファイルを用意 DEFAULT vmlinuz APPEND root=/dev/nfs rw nfsroot=192.168.90.100:/home/kodama/001 ¥ ip=192.168.90.1:192.168.90.100::255.255.255.0:::
実際に試してみる 構築メモを参考に
その他 メモリテストしたら 1 枚不良があった （40枚中）． スケジューラーの導入については, また後日. MPI のインストールはこれから． 早く DennouRuby の amd64 用の Debian パッケージを作って > 佐々木様
参考文献 ディスクレスクラスタ http://grape.mtk.nao.ac.jp/~makino/articles/diskless-note/doc/files/_/_diskless-note_cp.html http://blog.asial.co.jp/329 http://www.jp.debian.org/releases/stable/amd64/ch04s03.html.ja http://www.linux.or.jp/JF/JFdocs/NFS-Root-Client.html http://www.linux.or.jp/JF/JFdocs/NFS-Root.html
GCOE 観測ネットワークで,… 大容量・低価格ファイルサーバを作ります 1TB x 16, 2 台 誰か一緒に作りましょう 国立天文台 CfCA 大容量・低価格ファイルサーバ