【MedR】第1回 東京大学医学系研究科 特任助教　倉橋一成.

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1 【MedR】第1回 東京大学医学系研究科 特任助教　倉橋一成

2 簡単な自己紹介 修道（広島）→東大理科Ⅰ類→看護学科→ 疫学・生物統計学教室大学院（大橋教室）→ 企画情報運営部（大江教室）
修道（広島）→東大理科Ⅰ類→看護学科→ 疫学・生物統計学教室大学院（大橋教室）→ 企画情報運営部（大江教室） 修士1年まで生物統計学の勉強 修士2年から少しずつ働き始める 健康診断＆レセプトデータ 臨床試験データ 遺伝子データ（マイクロアレイ） R or SASで解析（今は99%R） 解析実務 解析相談、アドバイザー、コンサルティング VC++ & Rでレセプトデータの加工を行うソフト作ったり SAS講習会の通訳補助やったり iAnalysis（アイアナリシス）という会社で兼業中

3 R S言語をオープンソースとして実装 再現可能な言語 世界的に信頼性が高い Rで分からないことがあったら。。 GPL
同じプログラムを実行すれば同じ結果となる SASも再現可能 SPSSは再現するためにはデータ加工やオプション設定を保存する必要がある 世界的に信頼性が高い SASと同等 他にはMatLabなど グラフィックスに強い 論文でも多く利用されている NEJM、JCO、JNCIなど 方法論の教科書の著者がRパッケージを作っていることも Rで分からないことがあったら。。 Rjpwiki： ツイッターでつぶやく 私のID: isseing333

4 使い方 インストール これ を起動 http://cran.r-project.org/bin/windows/base/ 特に設定変更なし
これ　　　を起動 この画面にプロ グラムを書く

5 例＆終了 Plot(1:10) これだけでも割と綺麗 終了 「いいえ」 作業スペース：R上のオブジェクト

6 パッケージとヘルプ タスクビューで特に重要なパッケージを紹介 パッケージのインストール ヘルプ
パッケージのインストール インターネットが繋がっている状態 Install.packages(“パッケージ名”) ミラーサーバーを選ぶと自動インストール 日本は筑波、兵庫、（会津） library(“パッケージ名”)で使えるようになる ヘルプ 「?関数名」と打つとヘルプが表示される

7 データ例 library(HSAUR2) data(Forbes2000) dim(Forbes2000) ｓｔｒ（Forbes2000）
Forbes Magazine 2004年世界の一流企業2,000 dim(Forbes2000) ｓｔｒ（Forbes2000） names(Forbes2000) Forbes2000[1:10, ] nlevels(Forbes2000$country) a <- Forbes2000[Forbes2000$country == "Japan", ] dim(a) nrow(a)/nrow(Forbes2000) length(Forbes2000[Forbes2000$country == "United States", 1])