各種PC クラスタの性能評価 同志社大学　工学部 廣安　知之 三木　光範 谷村　勇輔.

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1 各種PC クラスタの性能評価 同志社大学　工学部 廣安　知之 三木　光範 谷村　勇輔

2 日給 \5,000だったら 1ヶ月も働くと．．． DSO/VパラダイスMagnate SDX 81,800円
Pentium 4 1.6GHz Memory 256MB HDD 40GB Pentium 4 1.7GHz 89,800円 パソコン工房 AMPHIS-1700M4R TWO-TOP ViP 84N-SP1500 　 90,800円 Pentium 4 1.5GHz HDD 20GB 1ヶ月も働くと．．．

3 コモディティハードウエア CPU ハードウエア ネットワーク 性能の向上 価格の急激な下落
COTS (Commodity-off-the-Shelf)-based scalable parallel systems

4 PCクラスタ Hardware CPU memory motherboard hard disc case network card
cable hub

5 Super Computer TOP 500 http://www.top500.org Ranking Name # Proc 1
Rmax (Gflops) 1 ASCI White 8192 7226 2 AlphaServer SC ES45/1 GHz 3024 4059 3 Power3 375 MHz 16 way 3228 3052 4 ASCI Red 9632 2379 5 ASCI Blue-Pacific 5808 2144

6 Super Computer TOP 500(self made)
Ranking Name # Proc Rmax (Gflops) 30 CPlant/Ross Cluster 1369 706.70 40 SCore IIIe/PIII 933 MHz 1024 618.30 86 Presto III Athlon 1.2 GHz 256 331.70 137 CLIC PIII 800 MHz 530 221.60 184 Netfinity Cluster PIII 1 GHz 320 184.40

7 同志社大学 クラスタシステム 知能情報センター Cambriaシステム Cambriaシステム 複数のアプリケーションによる
同志社大学　クラスタシステム 知能情報センター Cambriaシステム Cambriaシステム 複数のアプリケーションによる PCクラスタ特性の比較

8 Cambriaシステム仕様 CPU PentiumIII 800MHz 256CPU Memory 256MB（計 65.536GB）
Network Fast Ethernet OS Debian/GNU Linux Compiler gcc Communication Lam-6.6b1

9 Gregorシステム仕様 CPU PentiumIII 1GHz 128CPU （64 Nodes dual processor）
Memory 512MB（計 GB） Network Myrinet2000 OS Kondara HPC（Red Hat系） Compiler gcc　， g77 Communication MPICH1.2/GM1.3 Peak性能 128GFlops

10 Myrinet Myricom社が開発 最大転送速度が2Gbpsの高速通信
PCクラスタコンピューティングのデファクト・スタンダードとして期待 ｰ Ethernetより優れた性能，　 　 コストパフォーマンスを発揮

11 Linpack Benchmark Top５００などをはじめ広く使用 密行列の線形代数問題 ガウスの消去法 問題のサイズなどはユーザが指定
密行列の線形代数問題　ガウスの消去法 問題のサイズなどはユーザが指定 HPLを利用の際にはATLASを使用する 高速なCPU 多ノード 膨大なメモリ 高速なネットワーク 適切な放熱，電源処理 コンパイラに依存しない 並列計算機の総合的な評価に向いている

12 Linpack Benchmarkはネットワークに依存する
Myrinet2000とEthernetの比較 Linpack Benchmarkはネットワークに依存する

13 78.62GFlops Linpack 結果 Cambria 67.03/204.8 Gflops (N=80000)
Gregor 69.94/128.0 Gflops (N=40000) 78.62GFlops （84.58GFlops） 公式記録

14 カットオフのある粒子シミュレーション 比較的，通信量が 大きくなるプログラム 領域をどう分割するか？
カットオフ半径内に収まる粒子との相互作用を考える

15 結 果

16 最適化における並列化 GAの並列化など 感度の並列化など

17 Distributed Genetic Algorithms (Island GAs)
subpopulation migration

18 DGA Benchmark 乱数発生の繰り返し

19 DGAによる処理速度の向上

20 PCクラスタの性能 CPU メモリ ネットワーク 放熱問題
まとめ PCクラスタの性能 CPU メモリ ネットワーク 放熱問題 最適化問題 感度の並列 分散遺伝的アルゴリズム