サイエンス・テクノロジー・システムズ株式会社 癸生川絵里

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1 サイエンス・テクノロジー・システムズ株式会社 癸生川絵里
Ensembl？ サイエンス・テクノロジー・システムズ株式会社 癸生川絵里

2 （得られるゲノム情報は専用インターフェース等を含めフリーで提供している。）
What’s Ensembl？ EMBL-EBIとSangerCenterのジョイントプロジェクト 　 　　 公共データバンクからDNAデータを収集 　　 アセンブル 　　 アノテーション付加　　　　　　　　　　　　　　　 “Free Unrestricted Genome Access For All” 　　　（得られるゲノム情報は専用インターフェース等を含めフリーで提供している。） オープンソースソフトウェアとして特に以下が利用可能。 Web-Interface Database API ( Java, Perl ) Automaticに行うシステムを 開発、更新している。 ローカルに環境構築可能。 カスタマイズ可能。

3 Web-Interface

4 Ensembl Tour （Ensembl紹介）
Top page Ensembl　Tour （Ensembl紹介） Help Desk（重要） ＆Documents（重要） スライドショー中に画をダブルクリック。

5 多彩なView fastaview alignview anchorview familyview blastview
　chromoview 　contigview 　cytoview 　dasconfview 　diseaseview 　domainview 　dotterview 　exonview 　exportview 　fastaview familyview 　genesnpview 　geneview 　goview 　haplomapview 　haploview 　helpview 　karyoview 　markerview 　multicontigview 　primerview 　protview 　snpview 　syntenyview 　tagloview 　transview 　mapview 　martview 　textview などなどございます。是非ご探訪ください。

6 導入事例　ご紹介

7 ＜事例1＞ （ご内容） ■ Ensembl カスタマイズ&インストール - DASでインハウスデータを統合表示 - データ作成
情報・システム研究機構国立遺伝学研究所 生物遺伝資源情報総合センター 系統情報研究室　様 （ご内容） ■ Ensembl カスタマイズ&インストール 　- DASでインハウスデータを統合表示 　- データ作成 　- View編集 ■ データ更新 スライドショー中に画をダブルクリック。

8 ＜事例2＞ ○×△ 株式会社様 （ご内容） ■ Ensembl Powered カスタマイズ&インストール
　○×△　株式会社様 　（ご内容） ■ Ensembl Powered カスタマイズ&インストール Ensembl DBへ直接インハウスデータ 　を追加して統合表示 View編集 スライドショー中に画をダブルクリック。

9 Architecture browsers Apache / mod_perl web servers MySQL RDBMS
Web code Ensembl API Bioperl MySQL RDBMS Ensembl DBs ensembl.org

10 Database

11 Schemas（MySQL） Database

12 API 利用

13 API 直利用 ローカルサーバ、外部公開サーバの Ensemblデータベースに接続させることが できます。 欲しい情報をまとめて抽出し、
他プログラムと連携させることができます。

14 Happy, Ensembling ! ;) サイエンス・テクノロジー・システムズ(株)