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EduDV クリックしてください ネオン (Ne) 原子の電子(波動関数)を 計算して三次元可視化してみましょう! 10 Ne.

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1 eduDV クリックしてください ネオン (Ne) 原子の電子(波動関数)を 計算して三次元可視化してみましょう! 10 Ne

2 00. Automatic 【データ自動入力 】 クリックしてください 10 Ne

3 AUTO 21. 対称なし 【単原子】 クリックしてください 10 Ne

4 Atom 原子番号 01 ~ 20 クリックしてください 10 Ne

5 10 Ne Neon [He] 2s 2 2p 6 クリックしてください 10 Ne

6 「 f01 」タグが 表に出ています f01: 原子位置と原子番号が書いて ある DV-Xα の入力ファイル 10 Ne

7 f08e ネオン原子の電子 (原子軌道関数) のエネルギー準位表 軌道名 エネルギー (eV) 電子数 10 Ne

8 「 f01 」タグをクリッ ク して表に出して下さ い f01: 原子位置と原子番号が書いて ある DV-Xα の入力ファイル 10 Ne

9 VESTA クリックしてください F01 がアクティブ な 状態で VESTA を 起動します 10 Ne

10 Properties … クリックしてください 10 Ne

11 Properties ダイアログボックス Unit cell ( 単位格子 ) Line ( 線 ) Do not show ( 非表示 ) OK 10 Ne

12 Edit – Edit Data – Volumetric Data… 10 Ne

13 Import… Isosurfaces: 等値表面描画に用いるデータ 10 Ne

14 Ne2p-1p1.scat ネオンの 2p x 軌道 1m1: l ( 方位量子数 ) =1, m ( 磁気量子数 ) =-1, : p y 軌道 1p1: l ( 方位量子数 ) =1, m ( 磁気量子数 ) =+1, : p x 軌道 10: l ( 方位量子数 ) =1, m ( 磁気量子数 ) =0, : p z 軌道 10 Ne

15 1. Add to current data 2. OK 10 Ne

16 2. OK 10 Ne 1. Apply

17 Properties… 等値表面(曲面)の 値を変更する 10 Ne

18 Isosurfaces タ グ 10 Ne Isosurface level: 0.002 等値表面(曲面)の値が大きすぎる (波動関数の図が小さすぎる)ので、 値を小さくして図を大きくする クリッ ク

19 OK 10 Ne

20 拡大 (Zoom in) 10 Ne

21 ドラッグして波動関数 (等値曲面図)を回転さ せる 10 Ne

22 Show model のチェックを外 す 10 Ne

23 Rotation modes: Animation を選択 Tools タグをクリッ ク

24 File – Exit で VESTA を終 了 10 Ne

25 いいえ( N) 10 Ne

26 ファイル (F) – 全終了 (Q) 秀丸エディタを終了します 10 Ne

27 eduDV クリックしてください アルゴン (Ar) 原子の電子(波動関数)を 計算して三次元可視化してみましょう! 18 Ar

28 00. Automatic 【データ自動入力 】 クリックしてください 18 Ar

29 AUTO 21. 対称なし 【単原子】 クリックしてください 18 Ar

30 Atom 原子番号 01 ~ 20 クリックしてください 18 Ar

31 18 Ar Argon [Ne] 3s 2 3p 6 クリックしてください 18 Ar

32 「 f01 」タグが 表に出ています f01: 原子位置と原子番号が書いて ある DV-Xα の入力ファイル 18 Ar

33 f08e アルゴン原子の電子 (原子軌道関数) のエネルギー準位表 軌道名 エネルギー (eV) 電子数 18 Ar

34 「 f01 」タグをクリッ ク して表に出して下さ い f01: 原子位置と原子番号が書いて ある DV-Xα の入力ファイル 18 Ar

35 VESTA クリックしてください F01 がアクティブ な 状態で VESTA を 起動します 18 Ar

36 Properties … クリックしてください 18 Ar

37 Properties ダイアログボックス Unit cell ( 単位格子 ) Line ( 線 ) Do not show ( 非表示 ) OK 18 Ar

38 Edit – Edit Data – Volumetric Data… 18 Ar

39 Import… Isosurfaces: 等値表面描画に用いるデータ 18 Ar

40 Ar3p-1p1.scat アルゴンの 3p x 軌 道 1m1: l ( 方位量子数 ) =1, m ( 磁気量子数 ) =-1, : p y 軌道 1p1: l ( 方位量子数 ) =1, m ( 磁気量子数 ) =+1, : p x 軌道 10: l ( 方位量子数 ) =1, m ( 磁気量子数 ) =0, : p z 軌道 18 Ar

41 Add to current data OK 18 Ar

42 2. OK 1. Apply

43 Properties… 等値表面(曲面) の値を変更する 18 Ar

44 Isosurfaces タ グ 18 Ar Isosurface level: 0.1 等値表面(曲面)の値が小さすぎる (波動関数の図が大きすぎる)ので、 値を大きくして図を小さくする クリッ ク

45 OK 18 Ar

46 拡大 (Zoom in) 18 Ar

47 ドラッグして波動関数 (等値曲面図)を回転さ せる 18 Ar

48 Show model のチェックを外 す 18 Ar

49 Animation を選択 18 Ar 2p x 軌道と違い 、 3p x 軌道は位相 が入れ子構造 Tools タグをクリッ ク

50 File – Exit で VESTA を終 了 18 Ar

51 いいえ( N) 18 Ar

52 ファイル (F) – 全終了 (Q) 秀丸エディタを終了します 18 Ar

53 eduDV クリックしてください 水 (H 2 O) 分子の電子(波動関数)を 計算して三次元可視化してみましょう! H2OH2O

54 00. Automatic 【データ自動入力 】 クリックしてください H2OH2O

55 AUTO 07. C 2v 対称 【折れ線 AB 2 型分子 】 クリックしてください H2OH2O

56 c2v12n ( ノンスピン版 ・全自動実行 )… クリックしてください H2OH2O

57 H 2 O 水分子 ノンスピン 版 クリックしてください H2OH2O

58 「 f01 」タグが 表に出ています f01: 原子位置と原子番号が書いて ある DV-Xα の入力ファイル

59 f08e 水分子の電子 (分子軌道) のエネルギー準位表 軌道名 エネルギー (eV) 電子数 HOMO = 1b 2 軌道, LUMO = 4a 1 軌道

60 「 f01 」タグをクリッ ク して表に出して下さ い f01: 原子位置と原子番号が書いて ある DV-Xα の入力ファイル

61 VESTA クリックしてください F01 がアクティブ な 状態で VESTA を 起動します

62 Properties … クリックしてください H2OH2O

63 Properties ダイアログボックス Unit cell ( 単位格子 ) Line ( 線 ) Do not show ( 非表示 ) OKOK H2OH2O

64 H2OH2O Edit – Edit Data – Volumetric Data…

65 H2OH2O Import… Isosurfaces: 等値表面描画に用いるデータ

66 005_1b2.sca 水の 1b 2 分子軌道 004_3a1: 3a 1 分子軌道 (HOMO-1) 005_1b2: 1b 2 分子軌道 (HOMO) 006_4a1: 4a 1 分子軌道 (LUMO) H2OH2O

67 Add to current data OK H2OH2O

68 H2OH2O 2. OK 1. Apply

69 Properties… 等値表面(曲面)の 値を変更する H2OH2O

70 H2OH2O Isosurface level: 0.002 等値表面(曲面)の値が大きすぎる (波動関数の図が小さすぎる)ので、 値を小さくして図を大きくする Isosurfaces タグ クリッ ク

71 OK H2OH2O

72 拡大 (Zoom in) H2OH2O

73 ドラッグして波動関数 (等値曲面図)を回転さ せる H2OH2O

74 H2OH2O Animation を選択 Tools タグをクリッ ク

75 Drag に戻す H2OH2O

76 H2OH2O Edit – Edit Data – Volumetric Data…

77 Delete 005_1b2.sca ファイル (HOMO) をクリックして 選択 反転、 Delete ボタンで削 除 H2OH2O

78 H2OH2O Import… Isosurfaces: 等値表面描画に用いるデータ

79 006_4a1.sca 水の 4a 1 分子軌道 004_3a1: 3a 1 分子軌道 (HOMO-1) 005_1b2: 1b 2 分子軌道 (HOMO) 006_4a1: 4a 1 分子軌道 (LUMO) H2OH2O

80 Add to current data OK H2OH2O

81 H2OH2O 2. OK 1. Apply

82 Properties… 等値表面(曲面)の 値を変更する H2OH2O

83 H2OH2O 等値表面(曲面)の値が大きすぎる (波動関数の図が小さすぎる)ので、 値を小さくして図を大きくする Isosurface level: 0.02 Isosurfaces タグ クリッ ク

84 OK H2OH2O

85 拡大 (Zoom in) H2OH2O

86 ドラッグして波動関数 (等値曲面図)を回転さ せる H2OH2O

87 H2OH2O Animation を選択 Tools タグをクリッ ク

88 H2OH2O Drag に戻す

89 H2OH2O Edit – Edit Data – Volumetric Data…

90 Delete 006_4a1.sca ファイル (LUMO) をクリックして選 択 反転、 Delete ボタンで削 除 H2OH2O

91 H2OH2O Import… Isosurfaces: 等値表面描画に用いるデータ

92 CHG3D.scat 水の電子密度 CHG3D: 水分子の電子密度 POT3D: 水分子の静電ポテンシャ ル H2OH2O

93 Add to current data OK H2OH2O

94 H2OH2O Import… Surface coloring: 等値表面の彩色に用いるデータ

95 POT3D.scat 水の静電ポテンシャ ル CHG3D: 水分子の電子密度 POT3D: 水分子の静電ポテンシャ ル H2OH2O

96 Add to current data OK H2OH2O

97 H2OH2O 2. OK 1. Apply

98 Properties… 等値表面(曲面)の 値を変更する H2OH2O

99 H2OH2O 等値表面(曲面)の値が大きすぎる (電子密度の図が小さすぎる)ので、 値を小さくして図を大きくする Isosurface level: 0.02 Isosurfaces タグ クリッ ク

100 OK H2OH2O

101 拡大 (Zoom in) H2OH2O

102 ドラッグして静電ポテンシャルマッ プ (等値曲面彩色図)を回転させる H2OH2O 静電ポテンシャルマップ ~電子の僅かな偏りを見る ~ 赤い箇所: δ − 電子の多い所 青い箇所: δ + 電子の少ない所

103 H2OH2O Animation を選択 Tools タグをクリッ ク

104 H2OH2O Drag に戻す

105 File – Exit で VESTA を終 了 H2OH2O

106 いいえ( N) H2OH2O

107 ファイル (F) – 全終了 (Q) 秀丸エディタを終了します H2OH2O

108 eduDV クリックしてください ベンゼン (C 6 H 6 ) の電子(波動関数)を 計算して三次元可視化してみましょう! C6H6C6H6

109 00. Automatic 【データ自動入力 】 クリックしてください C6H6C6H6

110 AUTO 13. D 6h 対称 【 A 6 B 6 型分子】 クリックしてください C6H6C6H6

111 d6h66n ( ノンスピン 版 ・全自動実 行 ) クリックしてください C6H6C6H6

112 C 6 H 6 ベンゼン分子 ノンスピン版 クリックしてください C6H6C6H6

113 「 f01 」タグが 表に出ています f01: 原子位置と原子番号が書いて ある DV-Xα の入力ファイル

114 f08e ベンゼン分子の電子 (分子軌道) のエネルギー準位表 軌道名 エネルギー (eV) 電子数 HOMO = 1e 1g LUMO = 1e 2u

115 F08E.hlgap ベンゼン分子の HOMO と LUMO の エネルギー差 eV cm -1 ( 波数 ) nm( 波長 ) HOMO = 1e 1g LUMO = 1e 2u

116 「 f01 」タグをクリッ ク して表に出して下さ い f01: 原子位置と原子番号が書いて ある DV-Xα の入力ファイル

117 VESTA クリックしてください F01 がアクティブな 状態で VESTA を 起動します

118 Properties … クリックしてください C6H6C6H6

119 Properties ダイアログボックス Unit cell ( 単位格子 ) Line ( 線 ) Do not show ( 非表示 ) OK C6H6C6H6

120 C6H6C6H6 Edit – Edit Data – Volumetric Data…

121 C6H6C6H6 Import… Isosurfaces: 等値表面描画に用いるデータ

122 020_1e1g.sca 020_1e1g: 1e 1g (HOMO) 021_1e1g: 1e 1g (HOMO) 022_1e2u: 1e 2u (LUMO) 023_1e2u: 1e 2u (LUMO) C6H6C6H6 二重縮退 縮退:同じエネルギー準位で 完全に重なり合っていること エネルギーは重なり合って いるが、波動関数の形は違う

123 Add to current data OK C6H6C6H6

124 C6H6C6H6 2. OK 1. Apply

125 拡大 (Zoom in) C6H6C6H6

126 ドラッグして波動関数 (等値曲面図)を回転さ せる C6H6C6H6

127 C6H6C6H6 Animation を選択 Tools タグをクリッ ク

128 C6H6C6H6 Drag に戻す

129 C6H6C6H6 Edit – Edit Data – Volumetric Data…

130 Delete 020_1e1g.sca ファイル (HOMO) をクリックして 選択 反転、 Delete ボタンで削 除 C6H6C6H6

131 C6H6C6H6 Import… Isosurfaces: 等値表面描画に用いるデータ

132 022_1e2u.sca 020_1e1g: 1e 1g (HOMO) 021_1e1g: 1e 1g (HOMO) 022_1e2u: 1e 2u (LUMO) 023_1e2u: 1e 2u (LUMO) C6H6C6H6 二重縮退 縮退:同じエネルギー準位で 完全に重なり合っていること エネルギーは重なり合って いるが、波動関数の形は違う

133 Add to current data OK C6H6C6H6

134 C6H6C6H6 2. OK 1. Apply

135 C6H6C6H6 Animation を選択 Tools タグをクリッ ク

136 C6H6C6H6 Drag に戻す

137 C6H6C6H6 Edit – Edit Data – Volumetric Data…

138 Delete 022_1e2u.sca ファイル (LUMO) をクリックして選 択 反転、 Delete ボタンで削 除 C6H6C6H6

139 C6H6C6H6 Import… Isosurfaces: 等値表面描画に用いるデータ

140 CHG3D.scat CHG3D: 水分子の電子密度 POT3D: 水分子の静電ポテンシャ ル C6H6C6H6

141 Add to current data OK C6H6C6H6

142 C6H6C6H6 Import… Surface coloring: 等値表面の彩色に用いるデータ

143 POT3D.scat CHG3D: 水分子の電子密度 POT3D: 水分子の静電ポテンシャ ル C6H6C6H6

144 Add to current data OK C6H6C6H6

145 C6H6C6H6 2. OK 1. Apply

146 Properties… 等値表面(曲面)の 値を変更する C6H6C6H6

147 等値表面(曲面)の値が大きすぎる (電子密度の図が小さすぎる)ので、 値を小さくして図を大きくする C6H6C6H6 Isosurface level: 0.02 Isosurfaces タグ クリッ ク

148 OK C6H6C6H6

149 ドラッグして静電ポテンシャルマ ップ (等値曲面彩色図)を回転させる 静電ポテンシャルマップ ~電子の僅かな偏りを見る ~ 赤い箇所: δ − 電子の多い所 青い箇所: δ + 電子の少ない所 C6H6C6H6

150 C6H6C6H6 Animation を選択 Tools タグをクリッ ク

151 C6H6C6H6 Drag に戻す

152 File – Exit で VESTA を終 了 C6H6C6H6

153 いいえ( N) C6H6C6H6

154 ファイル (F) – 全終了 (Q) 秀丸エディタを終了します C6H6C6H6

155 eduDV クリックしてください 六フッ化ウラン (UF 6 ) の電子(波動関数)を 計算して三次元可視化してみましょう! UF 6

156 00. Automatic 【データ自動入力 】 クリックしてください UF 6

157 AUTO 15. O h 対称 【 AB 6 型分子】 クリックしてください UF 6

158 oh16n ( ノンスピン 版 ・全自動実 行 ) クリックしてください UF 6

159 UF 6 六フッ化ウラン分 子 ノンスピン版 クリックしてください UF 6

160 「 f01 」タグが 表に出ています f01: 原子位置と原子番号が書いて ある DV-Xα の入力ファイル

161 oh16n_UF6_time.txt 六フッ化ウラン分子 の分子軌道計算に 要した計算時間 計算開始時刻 計算終了時刻

162 f08e 六フッ化ウラン分子 の電子(分子軌道) の エネルギー準位表 軌道名 エネルギー (eV) 電子数 HOMO = 10t 1u LUMO = 2a 2u

163 F08E.hlgap 六フッ化ウラン分子の HOMO と LUMO の エネルギー差 eV cm -1 ( 波数 ) nm( 波長 ) HOMO = 10t 1u LUMO = 2a 2u

164 「 f01 」タグをクリッ ク して表に出して下さ い f01: 原子位置と原子番号が書いて ある DV-Xα の入力ファイル

165 VESTA クリックしてください F01 がアクティブな 状態で VESTA を 起動します

166 ウランとフッ素の結合の線 が 引かれていない … UF 6

167 Edit - Bonds … UF 6

168 2. Search A2 bonded to A1 クリッ ク 1. クリッ ク

169 F (フッ素 ) UF 6

170 1.6 Å では短すぎ るので 2.0 Å に する UF 6

171 2. OK 1. Apply

172 Properties … クリックしてください UF 6

173 Properties ダイアログボックス UF 6 Unit cell ( 単位格子 ) Line ( 線 ) Do not show ( 非表示 ) OK

174 UF 6 Edit – Edit Data – Volumetric Data…

175 UF 6 Import… Isosurfaces: 等値表面描画に用いるデータ

176 071_10t1u.sca 071_10t1u: 10t 1u (HOMO) 072_10t1u: 10t 1u (HOMO) 073_10t1u: 10t 1u (HOMO) 074_2a2u: 2a 2u (LUMO) 三重縮退 縮退:同じエネルギー準位で 完全に重なり合っていること エネルギーは重なり合って いるが、波動関数の形は違う UF 6

177 Add to current data OK UF 6

178 2. OK 1. Apply

179 拡大 (Zoom in) UF 6

180 Animation を選択 Tools タグをクリッ ク

181 UF 6 Drag に戻す

182 File – Exit で VESTA を終 了 UF 6

183 いいえ( N) UF 6

184 ファイル (F) – 全終了 (Q) 秀丸エディタを終了します UF 6


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