生物統計学・第12回 エクセルを使いこなす ワークシート操作、ワークシート関数、マクロ、VBA 2013年12月25日 生命環境科学域 応用生命科学類 尾形 善之
本日の予定 ノートパソコン組 実習 スクリーン組 実演
本日の内容 座学 ノートパソコン組 スクリーン組 チェックポイントがあります 予め課題を見せるので、挑戦してください 何かあればTAに尋ねてください スクリーン組 これまでの統計解析のうち、エクセルで実行できるものを実演します 最後に課題を出します
外れ値 グラブスの検定 目的 手順 データセット中でひとつだけ離れた値を外す 纏めて省くとき クラスタリング、主成分分析 離れていると予想される値の𝑍値を計算 グラブスの表で𝑝値を得る
グラブスの検定 A B 1 35 31 2 26 27 3 41 8 平均 34 22 SD 6 10 長さ 60 42 26−34 6 =1.333 8−22 10 =1.400 どちらも1%の危険率で有意に外れる 実験数 5% 1% 3 1.153 1.155
チェックポイント・I データセットからひとつだけ外れたデータを外す手順は？ データセットからふたつ以上の外れたデータを外す方法は？
9 5 7 2 2種類のエラーの話 眼鏡 教員 植物 視力 若さ 声が大きい コンピュータ リーダーシップ 馬好き 四十代 ウェット 教授 声がかなり大きい… リーダーシップ 酒に呑まれる… 眼鏡 四十代 教授 教員 アロハ 犬嫌い かずさＤＮＡ研究所 ＳＮＳ嫌い 馬好き コンピュータ ウェット バイオインフォマティクス ジブリ好き トマト 植物 微生物 生物統計学… 若さ 視力 9 5 7 2
9 5 7 青木先生が王様だったら… 正解！ 5 9+5 = 5 14 5 7+5 = 5 12 偽陽性 False Positive 偽陰性 False Negative 5 9+5 = 5 14 5 7+5 = 5 12 Recall Precision
9 5 7 私が王様だったら… 正解！ 5 9+5 = 5 14 5 7+5 = 5 12 偽陽性 False Positive 偽陰性 False Negative 5 9+5 = 5 14 5 7+5 = 5 12 Precision Recall
2種類のエラー PrecisionとRecallは対になっている 王様（理論値）がいる場合 王様（理論値）がいない場合 ふたつの指標を合わせると相関指標になる F-measure（ふたつの指標の調和平均） 5 9+5 = 5 14 5 7+5 = 5 12 𝐹= 5+5 14+12 = 10 26 = 5 13
生物統計学と2種類のエラー ある病気の検査方法の信頼度は？ 8 12 80 𝑃𝑟𝑒𝑐𝑖𝑠𝑖𝑜𝑛= 8 20 =40% 検査で 陽性 陰性 実際に True Positive 8 False Negative False Positive 12 True Negative 80 92 20 𝑃𝑟𝑒𝑐𝑖𝑠𝑖𝑜𝑛= 8 20 =40% 𝑅𝑒𝑐𝑎𝑙𝑙= 8 8 =100%
生物統計学と2種類のエラー 偽陽性 検査で陽性 精密検査で陰性 ほっとひと息 偽陰性 検査で陰性 実は陽性 これは困る
情報学と2種類のエラー あるブラウザの検出の信頼度は？ 8 992 999,000 𝑃𝑟𝑒𝑐𝑖𝑠𝑖𝑜𝑛= 8 1000 =0.8% ブラウザで ヒット ノーヒット 目的の ページ 8 関係ない 992 999,000 999,992 1000 𝑃𝑟𝑒𝑐𝑖𝑠𝑖𝑜𝑛= 8 1000 =0.8% 𝑅𝑒𝑐𝑎𝑙𝑙= 8 8 =100%
情報学と2種類のエラー あるブラウザの検出の信頼度は？ 3 5 7 999,985 𝑃𝑟𝑒𝑐𝑖𝑠𝑖𝑜𝑛= 3 10 =30% ブラウザで ヒット ノーヒット 目的の ページ 3 5 8 関係ない 7 999,985 999,992 10 999,990 𝑃𝑟𝑒𝑐𝑖𝑠𝑖𝑜𝑛= 3 10 =30% 𝑅𝑒𝑐𝑎𝑙𝑙= 3 8 =37.5%
2種類のエラーの纏め 偽陽性 False Positive 偽陰性 False Negative 意識しないとどちらかのエラーを忘れがち 検査で陽性だが実際は陰性 「第一種の過誤（誤り）」「あわてんぼうのエラー」 偽陰性 False Negative 検査で陰性だが実際は陽性 「第二種の過誤（誤り）」「うっかりもののエラー」 意識しないとどちらかのエラーを忘れがち
チェックポイント・II 偽陽性とは？ 偽陰性とは？
今日の自習のポイント 今日は特にありません！
アンケート・III 次回からは解析環境の話です いま学校や自宅でエクセルが使える環境かどうか教えてください。 この講義にノートパソコンを持ってこられるかどうか教えてください。
本日の課題 下の検査結果について以下の問いに答えなさい。 7 1 3 89 PrecisionとRecallを計算し、この検査方法の信頼度について考察しなさい。 検査で陽性 検査で陰性 実際に 陽性 True Positive 7 False Negative 1 8 陰性 False Positive 3 True Negative 89 92 10 90