イントロ ＤＮＡ配列 意味
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DNA配列は化学的配列空間 を占める 4
生物学的可能空間 5
とても狭い でも、広い 6
太陽 おけら てのひら みみにみみず あめんぼ みつばち とんぼ かえる 7
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この形質の違いを決める遺伝因子は？ 9
遺伝子多型を用いた 集団遺伝学解析 組換え 種の進化系統樹 ヒトの多様性 (種内 遺伝子多型) 10 Nature Reviews Genetics 3, 380-390 (2002); doi:10.1038/nrg795 GENEALOGICAL TREES, COALESCENT THEORY AND THE ANALYSIS OF GENETIC POLYMORPHISMS 種の進化系統樹 Nature Reviews Genetics 3, 380-390 (2002); doi:10.1038/nrg795 GENEALOGICAL TREES, COALESCENT THEORY AND THE ANALYSIS OF GENETIC POLYMORPHISMS ヒトの多様性 (種内 遺伝子多型) 10
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私と遺伝統計学と臨床医学と ～みんなちがって、みんないい～ 30億塩基対 多型性箇所～１千万？ 210,000,000>>>>>65億人 12
Mapping 個々のマーカーについて検定する マーカー間の依存関係に興味がある
２マーカーの場合 Pairwise LD index r^2 chi^2(1)=r chi^2(2)
連鎖不平衡～マーカー間の非独立性 16
Pairwise 2-d plot 2^k types k(k+1)/2 = Combin(k,2) parametersで情報集約
Ψ 2^k types 2^k-1 parameters 2^k-1 parametersのまま。ただし、階層化することで情報集約
この状態を１つの測度で表して、それが有用たらしめることはできるか？ エントロピー r^k
離散的過ぎる・・・ ハミング距離の分布 変異のみ 組み換えも考慮 多型は宝 人口減の影響で多型がなくならないかどうかを指標に