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Slicer 3 チュートリアル SPLにおける腹部アトラス
Ion-Florin Talos, M.D.
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謝辞 NIH P41RR013218 (Neuroimage Analysis Center)
NIH U54EB (NA-MIC)
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免責条項 使用者は添付ライセンス内の内容と関連法に遵守してslicerを使用すること
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使用するソフトウェア,データセット Slicer 3(このチュートリアルではslicer3-3.0を使用) アトラスデータ
→ アトラスデータ → CT画像 ラベルマップ 3Dモデル
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学習目標 アトラスデータの読み込み 体内の独自の3Dviewの製作と表示
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チュートリアルにおける必要条件 Slicer Training データの読み込みと表示のチュートリアルを行うこと
→ 6
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要旨 Part 1: 腹部アトラスデータの読み込み Part 2:体内の独自の3Dviewの製作と表示 7
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腹部アトラスデータの読み込み 解剖学的な濃淡値データ (CTやMRI等の画像データ) ………………….
MRMLシーン …………………………. 3Dモデル……………………………… ラベルマップ……………………………
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アトラスデータの読み込み Fileメニューより,Load Sceneを選択.
ポップウィンドウにおいて, Abdominal_Atlas2008.mrmlを選択し, Openをクリック.
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アトラスデータの読み込み 3Dモデル ラベルマップで オーバーレイされた CT画像
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要旨 Part 1: 腹部アトラスデータの読み込み Part 2:体内の独自の3Dviewの製作と表示
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独自の3Dviewの製作 Modelsモジュールのvisibilityより,3Dモデルが各構造毎に表示するかどうかを選択できることから,独自の体内の3Dviewを製作することが可能.
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独自の3Dview
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独自の3Dviewの製作(1) Modulesより,Modelsモジュールを選択. Hierarchy & Displayタブを開く
Model Display欄より,Select Model or Hierarchyにおいて,モデルを選択し,そのモデルを3DViewer内で表示したいならば,Visibilityのチェック欄にチェックを入れる. (チェックを入れなければ,表示されない)
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独自の3Dviewの製作(2) Modulesより,Dataモジュールを選択.
Create Scene Snapshotをクリックし,ポップアップウィンドウにおいて,独自の3Dviewの名前を記入. (例：Portal Circulation)
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独自の3Dviewの製作(3) Scene Snapshotの右側の欄をクリックすると,これまでに作成したスナップショットのデータファイル名も出てくるので,そこから選ぶことも可能である. 保存ファイル名が決定すれば,Restoreをクリック.
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補足(1) スライド14~16に関しては,slicer3-3.0バージョンにおけるスナップショット方法である.
3.2,3.4バージョンにおけるスナップショット方法を説明する.
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補足(2)
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補足(3)
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補足(4)
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監守：波多 伸彦 * * Surgical Plannninng Laboratory, Harvard Medical School
翻訳 スライド翻訳：木西 基 ** 監守：波多 伸彦 * * Surgical Plannninng Laboratory, Harvard Medical School ** 知的画像処理研究室, 立命館大学
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