１．臨床大学院コース ３ ４ ５ ６ ７ ８ ９ １０ 後期専門研修 大学院 ２．臨床専門コース ３ ４ ５ ６ ７ ８ ９ １０ ３ ４ ５ ６ ７ ８ ９ １０ 後期専門研修 大学院 ２．臨床専門コース ３ ４ ５ ６ ７ ８ ９ １０ 後期専門研修 大学専門研修 専門研修 ３．早期大学院コース ３ ４ ５ ６ ７ ８ ９ １０ 大学院 専門研修 大学院 後期専門研修 専門研修 後期専門研修 大学院 専門研修
１．基本となるコース。近年中に変更となる内科専門医制度にも対応している。 後期研修先は附属病院、センター病院の他に南部病院、南共済病院、藤沢市民病院、県立がんセンター、横浜保土ヶ谷中央病院、県立足柄上病院、横須賀市民病院、藤沢湘南台病院、秦野赤十字病院、横浜掖済会病院など。１‐２年単位の複数病院での研修も可能である。卒後３年での内科認定医、６年での内科専門医、消化器病学会専門医の取得を基本とする。 大学院においては基礎研究または臨床研究の選択をする。臨床研究を主とする場合は専門研修との重複が可能である。 ２．臨床を主に研修を行うコース。後期専門研修については上記と同様である。 その後の２年間（期間延長は対応可）は大学や専門施設（がんセンターなど）での研修を行う。 学位については乙号での取得が可能である。 ３．早期に研究を行うコース。後期専門研修の途中からでも変更可能である。大学院については基本コースと同様である。 各コースについては入門時の卒後年数に応じて柔軟に対応する。 海外留学については学位取得後が原則であるが、希望により早期に行うことも可能である。