H25年5月22日(水) 中央水研 「水産資源のデータ解析入門」 Terrapub

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H25年5月22日(水) 中央水研 「水産資源のデータ解析入門」 Terrapub      テキストの解説 H25年5月22日(水) 中央水研 「水産資源のデータ解析入門」 Terrapub

水産資源のデータ解析入門 3200円+税 著者割り・・・1冊2688円(税込み) 送料420円(ただし2冊以上無料)   水産資源のデータ解析入門 3200円+税 著者割り・・・1冊2688円(税込み) 送料420円(ただし2冊以上無料) 恒星社厚生閣の小浴(こさか)さんに   「赤嶺先生メール」という件名で注文。   kosaka@kouseisha.com ※ 「基礎」も同様

テキストの修正 「n」の事後分布(p.76) 負の二項分布(パスカル分布) 根号の規約(p.141) 10行目の数式は正しい。       テキストの修正 「n」の事後分布(p.76)   負の二項分布(パスカル分布) 根号の規約(p.141)   10行目の数式は正しい。   12行目の数式は誤り。   「資料」のp.22を参照のこと。

(1)回帰直線の推定と検定 テキストの第4章 「基礎」の例題5.1・・・生残率の推定 エクセルによる実演

(2)成長式の推定と検定 テキストの第4章 「基礎」の例題2.2、例題2.3 エクセルによる実演

(3)体長組成の年齢分解 テキストの第3章 「基礎」の例題1.1、例題1.2 エクセルによる実演

(4)区間推定の考え方 基本はHDR(最高密度領域) 従来は「信頼区間」・・・頻度論 ベイズでは「確率区間」と同じ 事前分布は「PMP」   事前分布は「PMP」     Probability Matching Prior テキストの第5章(p.70)と第6章

      HDRの説明図

(5)統計学やモデルの誤用例 (数理)生態学の教科書に多し! テキスト内および「資料」で紹介

1 水産資源解析学の歴史 ロトカ・ヴォルテラ・・・1920年代、生態学 戦前・・・無視してよい 1950年代・・・黄金時代 1 水産資源解析学の歴史 ロトカ・ヴォルテラ・・・1920年代、生態学 戦前・・・無視してよい 1950年代・・・黄金時代 1980年代・・・パソコンの普及 系群?・・・種と同様、便宜的な定義         個体群と同じ

2 連立方程式の解法 数値計算の基礎 卒論(実用性は低い) 良条件と悪条件・・・対角成分が重要      (ill condition)

3 混合正規分布 統計学の問題がすべて含まれている? 島谷(2012) 非線型パラメータ推定 マルカール法、X-Yプロッター 3 混合正規分布 統計学の問題がすべて含まれている?   島谷(2012) 非線型パラメータ推定 マルカール法、X-Yプロッター ハッセルブラッド法、EMアルゴリズム 真子・松宮の方法 統計学や数値計算の専門家(最近)

      混合正規分布

エクセルで計算 相澤・滝口(1999)のバグ情報 B134セルに =SUM(B83:B133) を入力 F列まで右にコピー(B→F) B134セルに =SUM(B83:B133)   を入力 F列まで右にコピー(B→F) 五利江(2002)

計算例(キダイのデータ)

4 成長式あれこれ 周期関数による拡張 リチャーズ式 再生産式の一般式(シュヌート式) パラメータ推定(非線型) 4 成長式あれこれ 周期関数による拡張 リチャーズ式 再生産式の一般式(シュヌート式) パラメータ推定(非線型) 主成分分析・・・粕谷(1998)の誤り Thieme(2003)、瀬野(2007)の誤り

ベルタランフィーの成長式 増加量=同化量-異化量 微分方程式 ベクトル場

ベルタランフィーのベクトル場

  ベルタランフィーの成長式                         (標準型)

ロジスティック式

ゴンペルツの成長式

リチャーズの成長式(1959)

リチャーズの成長式

     指数関数の定義

   指数関数の定義(2)

2つの曲線の検定(F検定)

周期関数による拡張

大分県のハマグリの成長曲線

再生産式(1)

  再生産式(シュヌート式)

再生産式の図

 アロメトリー式

アロメトリー式の図

5 個体数推定は難しい! 枠どり法    ベイズ統計(負の2項分布) ピーターセン法    2項分布と超幾何分布 デルーリー法

枠どり法とピーターセン法 枠どり法、コドラート法、部分観察法 2項分布の n の推定 ピーターセン法(ペテルセン法) 2項分布の p の推定    2項分布の n の推定 ピーターセン法(ペテルセン法)    2項分布の p の推定 デルーリー法    2項分布の n と p の同時推定    (うまくいかない)

枠どり法の区間推定

ピーターセン法の区間推定

6 ベイズ統計と生態学 ポアソン分布の区間推定 Clark(2007)、松田(2008)の誤り フィッシャー情報量は不適当 不連続区間 6 ベイズ統計と生態学 ポアソン分布の区間推定 Clark(2007)、松田(2008)の誤り フィッシャー情報量は不適当 不連続区間 尤度比検定とベイズ統計   事前分布は「PMP」

   Clark J S (2007)

7 落ち穂拾い(最重要?) VPA 最大原理 マッケンドリック 死亡係数M ロジスティック 再生産式 個体群行列モデル

行列モデル(1)・・・レフコビッチ

行列モデル(2)

行列モデル(3)

     1変数のモデル

   算術平均 と 幾何平均

最大固有値の分布(横軸はn)

第8章以降 (数理)統計学の基礎的な演習 生物系の人は苦手 どうして「ガンマ関数」が出てくるのか?    n次元の球の表面積    (「資料」参照)