Julien Jomier Kitware Inc.

Slides:



Advertisements
Similar presentations
Division of Process Control & Process Systems Engineering Department of Chemical Engineering, Kyoto University
Advertisements

QCD Sum rule による中性子電気双極子 モーメントの再評価 永田 夏海(名古屋大学) 2012 年 3 月 27 日 日本物理学会第 67 回年次大会 共同研究者:久野純治,李廷容,清水康弘 関西学院大学.
自動映像生成のための パーティクルフィルタによるボールの追 跡 2007 年 3 月 21 日 神戸大学大学院自然科学研究科 矢野 一樹.
Sonia Pujol, PhD -1- National Alliance for Medical Image Computing Neuroimage Analysis Center 拡散テンソル画像 チュートリアル Sonia Pujol, Ph.D. Surgical Planning Laboratory.
Sonia Pujol, Ph.D. Surgical Planning Laboratory Harvard Medical School
コンピュータビジョン特論 第8回対象追跡 2006年11月22日 加藤丈和.
Sonia Pujol, Ph.D. Surgical Planning Laboratory Harvard Medical School
高精度画像マッチングを用いた SAR衛星画像からの地表変位推定
HOG特徴に基づく 単眼画像からの人体3次元姿勢推定
パノラマ動画像モデルによる 仮想空間表現システムの研究
Pose Tracking from Natural Features on Mobile Phones
画像処理工学 2012年2月2日 担当教員 北川 輝彦.
11章 ボリュームレンダリングを学ぶ 本来は目に見えない内部情報をレンダリングし可視化する技術
自己重力多体系の 1次元シミュレーション 物理学科4年 宇宙物理学研究室  丸山典宏.
要旨 解剖学的なMRIデータの読み込み,可視化 位置あわせされたfMRIデータと閾値を組み込む 腫瘍の3Dモデルを作成
Nonrigid Structure from Motion in Trajectory Space
Volume Extractor Ver 概要紹介と造形モデル例-
MATLAB測位プログラミングの 基礎とGT (1)
わかりやすいマルチスライスCTにおける画像再構成
Slicer 3 チュートリアル SPLにおける腹部アトラス
Windows Summit /8/2017 © 2010 Microsoft Corporation. All rights reserved. Microsoft, Windows, Windows Vista and other product names are or may be.
羽佐田葉子 2007年3月24日 アクロス研究会@静岡大学
(ラプラス変換の復習) 教科書には相当する章はない
ティコ第2星表を用いた限界等級の測定 目的 内容 宇宙粒子研究室 竹川涼太
Yuri Y. Boykov Marie-Pierre Jolly
第6章 カーネル法 修士2年 藤井 敬士.
音信号表現 音声波形のデジタル化(PCM) サンプリング、標本化定理、量子化 ソースフィルタモデル
画像処理 基礎.
Computer Graphics 第3回 座標変換 芝浦工業大学情報工学科 青木 義満
Bottom-UpとTop-Down アプローチの統合による 単眼画像からの人体3次元姿勢推定
膜タンパク質の 立体構造予測.
第11回   ディジタル画像(2) ディジタル画像処理(2)
スペクトル法の一部の基礎の初歩への はじめの一歩
半無限領域のスペクトル法による竜巻を模した渦の数値実験に向けた研究開発
画像処理工学 2013年1月23日 担当教員 北川 輝彦.
Songzhu Gao, Tetsuya Takiguchi, Yasuo Ariki (Kobe University) 
細胞の形と変形のための データ駆動型解析手法
5章  3次元形状を2次元面に投影する 3次元空間内に定義した形状を,2次元面上(ディスプレイのスクリーン面,プリンタの紙面など)に投影して表示するために必要になる変換について説明する.
高度情報演習1C 実践 画像処理プログラミング 第二回 演習課題
音響伝達特性を用いた単一マイクロホンによる話者の頭部方向の推定
第6章 特徴空間の変換 6.1 特徴選択と特徴空間の変換 6.2 特徴量の正規化 平成15年5月23日(金) 発表者 藤井 丈明
RTK-GPS用プログラムライブラリRTKLIBの開発・評価および応用
6. ラプラス変換.
創造設計演習(S&V演習) 提出課題 課題内容
岩村雅一 知能情報工学演習I 第13回(後半第7回) 岩村雅一
東京農業大学 東京情報大学 附属第一高等学校・中等部 附属第二高等学校 附属第三高等学校・中等部
Image Analogies SIGGRAPH 2001 宮崎大輔
-画像処理(空間フィルタリング)- 画像処理(空間フィルタリング)のモデルとその基本操作 雑音除去・平滑化への適用
ポリゴンメッシュ (2) - 変形と簡略化- 東京大学 精密工学専攻 大竹豊 資料および授業の情報は :
2次元系における超伝導と電荷密度波の共存 Ⅰ.Introduction Ⅱ.モデルと計算方法 Ⅲ.結果 Ⅳ.まとめと今後の課題 栗原研究室
東北大学 大学院情報科学研究科 応用情報科学専攻 田中 和之(Kazuyuki Tanaka)
Volume Extractor Ver 概要紹介と造形モデル例-
9.通信路符号化手法1 (誤り検出と誤り訂正の原理)
CGと形状モデリング 授業資料 1,2限: 大竹豊(東京大学) 3,4限: 俵 丈展(理化学研究所)
Number of random matrices
原子核物理学 第5講 原子核の振動と回転.
SIFTとGraph Cutsを用いた 物体認識及びセグメンテーション
Bottom-UpとTop-Down アプローチの組み合わせによる 単眼画像からの人体3次元姿勢推定
高精細計算を実現するAMR法フレームワークの高度化 研究背景と研究目的 複数GPU間での袖領域の交換と効率化
HMM音声合成における 変分ベイズ法に基づく線形回帰
8方向補間ブロックマッチングの実装 福永研究室 数理科学コース 学部4年 能城 真幸.
``Exponentiated Gradient Algorithms for Log-Linear Structured Prediction’’ A.Globerson, T.Y.Koo, X.Carreras, M.Collins を読んで 渡辺一帆(東大・新領域)
ベイズ音声合成における 事前分布とモデル構造の話者間共有
ポッツスピン型隠れ変数による画像領域分割
音響伝達特性モデルを用いた シングルチャネル音源位置推定の検討 2-P-34 高島遼一,住田雄司,滝口哲也,有木康雄 (神戸大) 研究の背景
ビデオデータベースを用いた 流体画像に基づくアニメーション生成
媒質中でのカイラル摂動論を用いた カイラル凝縮の解析
自己縮小画像と混合ガウス分布モデルを用いた超解像
ランダムプロジェクションを用いた音響モデルの線形変換
ネットワークを介した 計測制御システムの開発
Presentation transcript:

Julien Jomier Kitware Inc. Slicer3における位置あわせ Julien Jomier Kitware Inc.

位置あわせ 座標系変換 画像間だけでなく,モデル間や,モデルと画像の間においても可能 再度サンプリングを行い,結果として補間する 線形: 剛体, 類似度, アフィン 非線形: TPS, EBS, B-スプライン

座標系変換 j j i 重ね合わせ画像 の格子 i 固定画像の格子 y y’ 変換空間 x x’ 固定画像の物理座標 重ね合わせ画像 の物理座標

スケーリング 同じ患者における画像 MRI-T2画像 PET画像 128 x 128 256 x 256 スケール変換 Images provided as part of the project: “Retrospective Image Registration Evaluation”, NIH, Project No. 8R01EB002124-03, Principal Investigator, J. Michael Fitzpatrick, Vanderbilt University, Nashville, TN.

しないこと!! ピクセル空間における画像間の位置あわせ

位置あわせ手法の骨組み 位置あわせ手法 固定画像 計算 最適化 変換 補間 重ね合わせ 画像

重ね合わせ&固定画像の選択 原則として,固定画像と重ね合わせ画像の種類は 任意である.  原則として,固定画像と重ね合わせ画像の種類は   任意である.  重ね合わせ画像は固定画像の座標系へ   再度サンプリングされた画像である.

位置あわせにおける初期化 低解像度から高解像度へのアプローチ 全体の中心 高次モーメント (主な軸) ボリュームデータの再調整

相互情報量 相互情報量は画像間の画素値に依存する. ヒストグラムに基づく.

同時ヒストグラム:単一モダリティ 調整された画像 0から20の画素によって変換 白色 = 0 黒色 = 高い値 調整ミスは分散を引き起こす

同時ヒストグラム:多数モダリティ 調整された画像 0から20の画素によって変換 白色 = 0 黒色 = 高い値 調整ミスは分散を引き起こす

アフィン位置あわせ マッテス相互情報量 ヒストグラムの値域 空間におけるサンプリング スケール変換 -回転と変換は同じユニットではない

非線形変換 y y 変換 x x 固定画像 重ね合わせ画像

非線形変換 y y 変換 x x 固定画像 重ね合わせ画像

非線形変換 y x

B-スプライン 格子 y B-スプライン格子 Resampling Grid x

B-スプライン格子&画像格子

B-スプライン格子&画像格子 B-スプライン格子

B-スプライン格子&画像格子 B-スプライン格子 有効領域

B-スプライン格子&画像格子 B-スプライン格子

B-スプライン格子&画像格子 B-スプライン格子 有効領域

B-スプライン位置あわせ 相互情報量 (マッテス) L-BFGS-B法による最適化 非線形条件:境界線付近の領域における最適化を規制する.

Slicerにおけるデモ Slicerの起動 データの読み込み アフィン位置あわせ B-スプラインでの非線形位置あわせ 伝達関数の可視化

データの読み込み

アフィン位置あわせ

アフィン位置あわせ

非線形位置あわせ

非線形位置あわせ

伝達関数の調整

監守:波多 伸彦 * * Surgical Plannninng Laboratory, Harvard Medical School 翻訳 スライド翻訳:木西 基 **        監守:波多 伸彦 * * Surgical Plannninng Laboratory, Harvard Medical School ** 知的画像処理研究室, 立命館大学